Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RoraP51448 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RoraP51448 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RoraP51448 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RoraP51448 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RoraP51448 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RoraP51448 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RoraP51448 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RoraP51448 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RoraP51448 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RoraP51448 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RoraP51448 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RoraP51448 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RoraP51448 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RoraP51448 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RoraP51448 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RoraP51448 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RoraP51448 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RoraP51448 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RoraP51448 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RoraP51448 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RoraP51448 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RoraP51448 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RoraP51448 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RoraP51448 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RoraP51448 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RoraP51448 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RoraP51448 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RoraP51448 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RoraP51448 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RoraP51448 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RoraP51448 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RoraP51448 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RoraP51448 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RoraP51448 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RoraP51448 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RoraP51448 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RoraP51448 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RoraP51448 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RoraP51448 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RoraP51448 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RoraP51448 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RoraP51448 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RoraP51448 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RoraP51448 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RoraP51448 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RoraP51448 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RoraP51448 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RoraP51448 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RoraP51448 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RoraP51448 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RoraP51448 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RoraP51448 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RoraP51448 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RoraP51448 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RoraP51448 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RoraP51448 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RoraP51448 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RoraP51448 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RoraP51448 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RoraP51448 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RoraP51448 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RoraP51448 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RoraP51448 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RoraP51448 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RoraP51448 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RoraP51448 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RoraP51448 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RoraP51448 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RoraP51448 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RoraP51448 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RoraP51448 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RoraP51448 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RoraP51448 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RoraP51448 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RoraP51448 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RoraP51448 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RoraP51448 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RoraP51448 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RoraP51448 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RoraP51448 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RoraP51448 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RoraP51448 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RoraP51448 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RoraP51448 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RoraP51448 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RoraP51448 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RoraP51448 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RoraP51448 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RoraP51448 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RoraP51448 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RoraP51448 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RoraP51448 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RoraP51448 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RoraP51448 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RoraP51448 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RoraP51448 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RoraP51448 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RoraP51448 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RoraP51448 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms