Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa13P50711 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa13P50711 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,1■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,1■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,1■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defa13P50711 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defa13P50711 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
Defa13P50711 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16,08■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,07■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,03■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Defa13P50711 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15,99■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15,98■□□□□ 0,15
Defa13P50711 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15,98■□□□□ 0,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,4 ms