Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa10P50708 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa10P50708 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa10P50708 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa10P50708 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa10P50708 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa10P50708 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa10P50708 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms