Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdi1P50396 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdi1P50396 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gdi1P50396 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms