Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbp3P49194 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rbp3P49194 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rbp3P49194 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms