Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptx3P48759 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ptx3P48759 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ptx3P48759 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ptx3P48759 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms