Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gbx2P48031 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gbx2P48031 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gbx2P48031 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gbx2P48031 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms