Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tlx1P43345 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlx1P43345 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlx1P43345 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms