Protein–RNA interactions for Protein: P43135

Nr2f2, COUP transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f2P43135 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nr2f2P43135 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nr2f2P43135 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nr2f2P43135 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nr2f2P43135 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 984.5 ms