Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nkx1-2P42580 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nkx1-2P42580 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nkx1-2P42580 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nkx1-2P42580 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nkx1-2P42580 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130 ms