Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Elk3P41971 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elk3P41971 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elk3P41971 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Elk3P41971 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elk3P41971 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Elk3P41971 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elk3P41971 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elk3P41971 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elk3P41971 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elk3P41971 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Elk3P41971 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elk3P41971 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elk3P41971 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Elk3P41971 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Elk3P41971 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk3P41971 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk3P41971 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Elk3P41971 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms