Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pbx1P41778 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pbx1P41778 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pbx1P41778 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms