Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CskP41241 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CskP41241 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CskP41241 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CskP41241 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CskP41241 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CskP41241 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CskP41241 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CskP41241 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CskP41241 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CskP41241 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CskP41241 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CskP41241 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CskP41241 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CskP41241 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CskP41241 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CskP41241 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CskP41241 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CskP41241 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CskP41241 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CskP41241 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CskP41241 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CskP41241 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CskP41241 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CskP41241 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CskP41241 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CskP41241 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CskP41241 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CskP41241 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CskP41241 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CskP41241 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CskP41241 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CskP41241 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CskP41241 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CskP41241 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CskP41241 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CskP41241 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CskP41241 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CskP41241 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CskP41241 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CskP41241 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CskP41241 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CskP41241 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CskP41241 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CskP41241 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CskP41241 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CskP41241 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CskP41241 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CskP41241 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CskP41241 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CskP41241 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CskP41241 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CskP41241 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CskP41241 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CskP41241 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CskP41241 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CskP41241 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CskP41241 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CskP41241 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CskP41241 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CskP41241 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CskP41241 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CskP41241 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CskP41241 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CskP41241 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CskP41241 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CskP41241 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CskP41241 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CskP41241 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CskP41241 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CskP41241 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CskP41241 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CskP41241 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CskP41241 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CskP41241 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CskP41241 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CskP41241 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CskP41241 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CskP41241 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CskP41241 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CskP41241 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CskP41241 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CskP41241 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CskP41241 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CskP41241 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CskP41241 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CskP41241 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CskP41241 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CskP41241 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CskP41241 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms