Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ighmbp2P40694 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ighmbp2P40694 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ighmbp2P40694 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ighmbp2P40694 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ighmbp2P40694 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms