Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TpoP35419 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TpoP35419 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TpoP35419 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TpoP35419 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TpoP35419 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TpoP35419 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TpoP35419 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TpoP35419 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TpoP35419 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TpoP35419 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TpoP35419 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TpoP35419 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TpoP35419 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TpoP35419 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TpoP35419 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TpoP35419 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TpoP35419 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TpoP35419 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TpoP35419 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TpoP35419 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TpoP35419 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TpoP35419 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TpoP35419 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TpoP35419 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TpoP35419 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TpoP35419 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TpoP35419 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TpoP35419 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TpoP35419 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TpoP35419 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TpoP35419 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TpoP35419 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TpoP35419 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TpoP35419 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TpoP35419 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TpoP35419 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TpoP35419 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TpoP35419 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TpoP35419 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TpoP35419 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TpoP35419 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TpoP35419 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TpoP35419 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TpoP35419 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TpoP35419 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TpoP35419 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TpoP35419 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TpoP35419 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TpoP35419 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TpoP35419 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TpoP35419 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TpoP35419 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TpoP35419 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TpoP35419 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TpoP35419 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TpoP35419 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TpoP35419 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TpoP35419 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TpoP35419 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TpoP35419 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TpoP35419 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TpoP35419 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TpoP35419 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TpoP35419 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TpoP35419 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TpoP35419 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TpoP35419 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TpoP35419 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TpoP35419 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TpoP35419 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TpoP35419 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TpoP35419 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TpoP35419 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TpoP35419 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TpoP35419 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TpoP35419 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TpoP35419 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TpoP35419 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms