Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab5cP35278 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab5cP35278 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab5cP35278 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms