Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mmp13P33435 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mmp13P33435 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mmp13P33435 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms