Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc5P32043 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxc5P32043 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc5P32043 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc5P32043 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms