Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.3 ms