Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk4P30285 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk4P30285 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk4P30285 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cdk4P30285 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cdk4P30285 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms