Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vcam1P29533 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vcam1P29533 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vcam1P29533 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vcam1P29533 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms