Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nckap1P28660 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nckap1P28660 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nckap1P28660 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms