Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn10P28658 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn10P28658 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atxn10P28658 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn10P28658 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn10P28658 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn10P28658 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn10P28658 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atxn10P28658 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.9 ms