Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col2a1P28481 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col2a1P28481 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col2a1P28481 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col2a1P28481 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col2a1P28481 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms