Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv4P28322 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv4P28322 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Etv4P28322 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Etv4P28322 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Etv4P28322 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv4P28322 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Etv4P28322 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Etv4P28322 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Etv4P28322 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Etv4P28322 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Etv4P28322 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Etv4P28322 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Etv4P28322 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Etv4P28322 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Etv4P28322 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Etv4P28322 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Etv4P28322 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms