Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa3P28310 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa3P28310 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa3P28310 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa3P28310 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defa3P28310 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa3P28310 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa3P28310 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa3P28310 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Defa3P28310 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms