Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfraP26618 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfraP26618 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfraP26618 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms