Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
NfyaP23708 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfyaP23708 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfyaP23708 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NfyaP23708 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfyaP23708 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfyaP23708 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NfyaP23708 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfyaP23708 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NfyaP23708 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms