Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PparaP23204 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PparaP23204 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PparaP23204 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PparaP23204 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PparaP23204 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PparaP23204 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PparaP23204 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PparaP23204 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PparaP23204 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PparaP23204 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PparaP23204 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PparaP23204 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PparaP23204 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PparaP23204 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PparaP23204 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PparaP23204 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PparaP23204 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PparaP23204 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PparaP23204 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PparaP23204 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PparaP23204 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PparaP23204 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PparaP23204 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PparaP23204 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PparaP23204 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PparaP23204 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PparaP23204 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PparaP23204 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PparaP23204 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PparaP23204 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PparaP23204 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PparaP23204 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PparaP23204 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PparaP23204 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PparaP23204 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PparaP23204 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PparaP23204 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PparaP23204 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PparaP23204 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PparaP23204 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PparaP23204 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PparaP23204 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PparaP23204 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PparaP23204 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PparaP23204 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PparaP23204 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PparaP23204 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PparaP23204 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PparaP23204 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PparaP23204 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PparaP23204 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PparaP23204 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PparaP23204 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PparaP23204 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PparaP23204 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PparaP23204 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PparaP23204 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PparaP23204 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PparaP23204 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PparaP23204 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PparaP23204 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PparaP23204 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PparaP23204 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PparaP23204 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PparaP23204 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PparaP23204 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PparaP23204 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PparaP23204 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PparaP23204 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PparaP23204 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PparaP23204 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PparaP23204 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PparaP23204 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PparaP23204 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PparaP23204 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PparaP23204 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PparaP23204 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PparaP23204 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PparaP23204 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PparaP23204 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PparaP23204 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PparaP23204 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PparaP23204 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PparaP23204 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PparaP23204 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PparaP23204 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PparaP23204 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PparaP23204 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PparaP23204 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PparaP23204 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PparaP23204 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PparaP23204 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PparaP23204 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PparaP23204 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PparaP23204 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PparaP23204 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PparaP23204 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PparaP23204 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PparaP23204 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms