Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Abcb4P21440 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Abcb4P21440 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Abcb4P21440 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Abcb4P21440 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms