Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tnnc1P19123 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tnnc1P19123 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tnnc1P19123 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tnnc1P19123 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms