Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdc1P18828 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sdc1P18828 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sdc1P18828 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sdc1P18828 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc1P18828 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms