Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rps6ka1P18653 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6ka1P18653 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6ka1P18653 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rps6ka1P18653 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rps6ka1P18653 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms