Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChgbP16014 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChgbP16014 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChgbP16014 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgbP16014 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChgbP16014 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgbP16014 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgbP16014 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgbP16014 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgbP16014 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChgbP16014 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgbP16014 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgbP16014 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgbP16014 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgbP16014 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgbP16014 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgbP16014 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgbP16014 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgbP16014 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChgbP16014 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgbP16014 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgbP16014 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgbP16014 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgbP16014 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgbP16014 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgbP16014 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgbP16014 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms