Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd5P13379 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd5P13379 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd5P13379 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd5P13379 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd5P13379 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd5P13379 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd5P13379 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cd5P13379 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd5P13379 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd5P13379 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd5P13379 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd5P13379 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd5P13379 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd5P13379 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd5P13379 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms