Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vpreb2P13373 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Vpreb2P13373 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vpreb2P13373 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms