Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nr4a1P12813 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nr4a1P12813 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nr4a1P12813 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms