Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MdkP12025 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MdkP12025 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MdkP12025 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MdkP12025 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MdkP12025 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MdkP12025 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MdkP12025 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MdkP12025 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MdkP12025 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MdkP12025 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MdkP12025 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MdkP12025 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MdkP12025 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MdkP12025 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MdkP12025 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MdkP12025 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MdkP12025 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MdkP12025 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MdkP12025 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MdkP12025 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MdkP12025 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MdkP12025 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MdkP12025 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MdkP12025 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MdkP12025 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MdkP12025 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MdkP12025 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MdkP12025 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MdkP12025 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MdkP12025 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MdkP12025 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MdkP12025 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MdkP12025 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MdkP12025 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MdkP12025 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MdkP12025 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MdkP12025 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MdkP12025 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MdkP12025 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MdkP12025 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MdkP12025 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MdkP12025 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MdkP12025 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MdkP12025 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MdkP12025 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MdkP12025 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MdkP12025 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MdkP12025 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MdkP12025 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MdkP12025 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MdkP12025 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MdkP12025 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MdkP12025 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MdkP12025 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MdkP12025 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MdkP12025 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MdkP12025 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MdkP12025 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MdkP12025 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MdkP12025 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MdkP12025 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MdkP12025 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MdkP12025 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MdkP12025 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MdkP12025 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MdkP12025 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MdkP12025 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MdkP12025 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MdkP12025 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MdkP12025 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MdkP12025 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MdkP12025 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MdkP12025 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MdkP12025 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MdkP12025 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MdkP12025 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MdkP12025 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MdkP12025 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MdkP12025 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MdkP12025 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MdkP12025 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MdkP12025 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MdkP12025 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MdkP12025 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MdkP12025 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MdkP12025 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MdkP12025 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MdkP12025 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MdkP12025 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MdkP12025 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MdkP12025 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MdkP12025 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MdkP12025 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MdkP12025 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MdkP12025 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MdkP12025 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MdkP12025 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MdkP12025 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MdkP12025 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms