Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AppP12023 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AppP12023 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AppP12023 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
AppP12023 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AppP12023 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AppP12023 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AppP12023 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AppP12023 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AppP12023 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AppP12023 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AppP12023 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AppP12023 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AppP12023 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AppP12023 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AppP12023 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AppP12023 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AppP12023 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AppP12023 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AppP12023 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AppP12023 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AppP12023 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AppP12023 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AppP12023 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AppP12023 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AppP12023 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AppP12023 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AppP12023 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AppP12023 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AppP12023 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AppP12023 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AppP12023 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AppP12023 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AppP12023 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AppP12023 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AppP12023 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AppP12023 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AppP12023 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AppP12023 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AppP12023 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AppP12023 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AppP12023 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AppP12023 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AppP12023 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AppP12023 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AppP12023 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AppP12023 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AppP12023 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AppP12023 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AppP12023 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AppP12023 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AppP12023 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AppP12023 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AppP12023 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AppP12023 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AppP12023 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AppP12023 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AppP12023 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
AppP12023 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
AppP12023 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AppP12023 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
AppP12023 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AppP12023 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
AppP12023 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
AppP12023 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AppP12023 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AppP12023 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AppP12023 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AppP12023 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
AppP12023 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AppP12023 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AppP12023 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AppP12023 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AppP12023 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AppP12023 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AppP12023 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AppP12023 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AppP12023 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AppP12023 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AppP12023 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AppP12023 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AppP12023 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AppP12023 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AppP12023 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AppP12023 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AppP12023 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AppP12023 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AppP12023 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AppP12023 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AppP12023 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AppP12023 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AppP12023 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AppP12023 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AppP12023 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AppP12023 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AppP12023 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AppP12023 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AppP12023 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AppP12023 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AppP12023 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms