Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sub1P11031 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sub1P11031 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sub1P11031 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sub1P11031 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sub1P11031 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sub1P11031 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sub1P11031 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sub1P11031 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sub1P11031 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sub1P11031 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sub1P11031 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sub1P11031 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sub1P11031 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sub1P11031 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms