Protein–RNA interactions for Protein: P08226

Apoe, Apolipoprotein E, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApoeP08226 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApoeP08226 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApoeP08226 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ApoeP08226 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApoeP08226 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApoeP08226 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApoeP08226 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ApoeP08226 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApoeP08226 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ApoeP08226 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApoeP08226 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApoeP08226 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ApoeP08226 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ApoeP08226 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ApoeP08226 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ApoeP08226 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApoeP08226 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ApoeP08226 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ApoeP08226 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ApoeP08226 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ApoeP08226 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ApoeP08226 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms