Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb1bP06795 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb1bP06795 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb1bP06795 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb1bP06795 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Abcb1bP06795 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Abcb1bP06795 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Abcb1bP06795 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Abcb1bP06795 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Abcb1bP06795 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms