Protein–RNA interactions for Protein: P06339

H2-T23, H-2 class I histocompatibility antigen, D-37 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-T23P06339 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2-T23P06339 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-T23P06339 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-T23P06339 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-T23P06339 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-T23P06339 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-T23P06339 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-T23P06339 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-T23P06339 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-T23P06339 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-T23P06339 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2-T23P06339 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211 ms