Protein–RNA interactions for Protein: P06335

T-cell receptor gamma chain C region 5/10-13, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06335 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06335 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06335 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06335 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P06335 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06335 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P06335 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06335 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06335 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06335 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06335 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06335 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06335 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06335 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06335 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P06335 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06335 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
P06335 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06335 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06335 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P06335 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06335 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06335 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06335 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06335 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06335 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P06335 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06335 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06335 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06335 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06335 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06335 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06335 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06335 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P06335 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P06335 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06335 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06335 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P06335 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06335 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06335 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06335 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06335 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06335 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06335 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06335 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
P06335 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P06335 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06335 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06335 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06335 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
P06335 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06335 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06335 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06335 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06335 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06335 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06335 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06335 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06335 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06335 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P06335 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06335 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06335 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06335 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06335 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06335 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06335 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06335 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06335 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06335 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06335 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06335 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06335 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06335 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06335 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06335 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06335 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms