Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JunP05627 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JunP05627 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
JunP05627 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JunP05627 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JunP05627 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JunP05627 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JunP05627 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JunP05627 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
JunP05627 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JunP05627 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JunP05627 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JunP05627 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JunP05627 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JunP05627 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
JunP05627 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JunP05627 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JunP05627 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JunP05627 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JunP05627 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
JunP05627 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
JunP05627 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JunP05627 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
JunP05627 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JunP05627 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
JunP05627 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JunP05627 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JunP05627 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JunP05627 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
JunP05627 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
JunP05627 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JunP05627 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
JunP05627 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
JunP05627 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JunP05627 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JunP05627 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
JunP05627 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JunP05627 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JunP05627 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JunP05627 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JunP05627 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
JunP05627 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JunP05627 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JunP05627 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JunP05627 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JunP05627 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JunP05627 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JunP05627 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JunP05627 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JunP05627 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
JunP05627 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JunP05627 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
JunP05627 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
JunP05627 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
JunP05627 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JunP05627 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JunP05627 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JunP05627 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JunP05627 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JunP05627 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JunP05627 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JunP05627 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JunP05627 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JunP05627 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JunP05627 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JunP05627 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
JunP05627 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JunP05627 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JunP05627 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JunP05627 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JunP05627 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JunP05627 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JunP05627 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JunP05627 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JunP05627 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JunP05627 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JunP05627 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JunP05627 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
JunP05627 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JunP05627 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JunP05627 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
JunP05627 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JunP05627 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JunP05627 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JunP05627 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
JunP05627 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JunP05627 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JunP05627 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JunP05627 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
JunP05627 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JunP05627 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
JunP05627 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JunP05627 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JunP05627 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JunP05627 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JunP05627 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JunP05627 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JunP05627 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JunP05627 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
JunP05627 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms