Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgamP05555 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ItgamP05555 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgamP05555 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ItgamP05555 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgamP05555 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ItgamP05555 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ItgamP05555 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ItgamP05555 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms