Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prp2P05143 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prp2P05143 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prp2P05143 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prp2P05143 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prp2P05143 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prp2P05143 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prp2P05143 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prp2P05143 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms