Protein–RNA interactions for Protein: P05142

Prh1, Proline-rich protein HaeIII subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prh1P05142 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prh1P05142 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prh1P05142 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prh1P05142 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prh1P05142 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prh1P05142 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prh1P05142 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prh1P05142 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prh1P05142 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prh1P05142 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prh1P05142 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prh1P05142 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prh1P05142 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prh1P05142 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prh1P05142 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prh1P05142 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prh1P05142 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prh1P05142 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms