Protein–RNA interactions for Protein: P01819

Ig heavy chain V region MOPC 141, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01819 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01819 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01819 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01819 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01819 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01819 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01819 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01819 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01819 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01819 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01819 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01819 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01819 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01819 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01819 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01819 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01819 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01819 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01819 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01819 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01819 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01819 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01819 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P01819 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01819 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01819 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01819 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P01819 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01819 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01819 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P01819 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01819 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01819 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01819 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01819 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01819 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01819 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01819 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P01819 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01819 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01819 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01819 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01819 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01819 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01819 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01819 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01819 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01819 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01819 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01819 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01819 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01819 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01819 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01819 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01819 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01819 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01819 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01819 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01819 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01819 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01819 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01819 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P01819 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01819 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01819 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01819 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01819 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01819 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01819 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01819 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01819 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01819 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01819 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01819 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01819 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01819 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01819 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01819 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01819 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms