Protein–RNA interactions for Protein: P01791

Ig heavy chain V region HPCM6, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01791 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01791 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01791 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01791 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01791 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01791 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01791 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01791 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01791 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01791 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01791 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01791 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01791 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01791 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01791 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01791 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01791 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01791 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01791 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01791 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01791 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01791 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01791 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01791 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01791 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01791 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01791 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01791 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01791 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01791 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01791 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01791 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01791 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01791 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01791 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01791 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01791 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01791 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01791 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01791 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01791 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01791 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01791 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01791 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01791 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01791 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01791 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01791 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01791 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01791 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01791 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01791 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01791 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01791 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01791 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01791 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01791 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01791 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01791 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01791 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01791 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01791 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01791 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01791 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01791 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01791 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01791 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01791 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01791 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01791 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01791 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01791 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01791 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01791 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01791 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01791 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01791 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01791 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01791 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01791 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
P01791 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01791 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01791 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01791 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01791 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01791 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01791 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01791 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01791 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01791 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01791 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01791 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01791 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01791 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01791 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01791 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01791 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01791 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01791 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01791 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms