Protein–RNA interactions for Protein: P01786

Ig heavy chain V region MOPC 47A, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01786 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01786 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01786 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01786 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01786 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01786 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01786 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01786 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01786 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01786 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01786 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01786 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01786 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01786 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01786 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01786 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01786 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01786 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01786 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01786 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01786 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01786 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01786 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01786 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01786 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01786 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01786 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01786 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01786 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01786 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01786 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01786 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01786 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01786 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01786 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01786 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01786 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01786 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01786 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01786 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01786 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01786 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01786 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01786 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01786 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01786 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01786 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01786 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01786 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01786 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01786 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01786 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01786 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01786 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01786 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01786 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01786 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01786 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01786 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01786 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01786 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01786 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01786 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01786 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01786 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01786 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01786 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01786 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01786 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01786 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01786 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01786 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01786 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01786 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01786 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01786 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01786 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01786 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01786 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01786 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms